Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna1sQ02789 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms