Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PrkcqQ02111 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms