Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms