Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms