Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top2aQ01320 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms