Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EgfrQ01279 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EgfrQ01279 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms