Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited1P97769 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Cited1P97769 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited1P97769 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited1P97769 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited1P97769 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited1P97769 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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