Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ptprn2P80560 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ptprn2P80560 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ptprn2P80560 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ptprn2P80560 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ptprn2P80560 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ptprn2P80560 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ptprn2P80560 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ptprn2P80560 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ptprn2P80560 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ptprn2P80560 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ptprn2P80560 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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