Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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