Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbdsP70122 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbdsP70122 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms