Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubb4bP68372 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms