Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tra2bP62996 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms