Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arf6P62331 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arf6P62331 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arf6P62331 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Arf6P62331 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arf6P62331 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms