Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CgnP59242 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CgnP59242 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CgnP59242 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CgnP59242 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CgnP59242 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CgnP59242 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CgnP59242 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CgnP59242 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CgnP59242 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CgnP59242 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CgnP59242 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CgnP59242 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CgnP59242 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CgnP59242 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CgnP59242 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CgnP59242 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CgnP59242 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CgnP59242 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CgnP59242 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CgnP59242 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CgnP59242 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CgnP59242 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CgnP59242 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CgnP59242 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CgnP59242 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CgnP59242 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CgnP59242 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CgnP59242 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CgnP59242 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CgnP59242 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CgnP59242 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CgnP59242 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CgnP59242 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CgnP59242 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CgnP59242 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CgnP59242 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CgnP59242 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CgnP59242 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CgnP59242 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CgnP59242 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CgnP59242 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CgnP59242 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CgnP59242 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CgnP59242 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CgnP59242 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CgnP59242 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CgnP59242 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CgnP59242 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CgnP59242 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CgnP59242 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CgnP59242 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CgnP59242 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CgnP59242 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CgnP59242 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CgnP59242 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CgnP59242 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CgnP59242 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CgnP59242 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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CgnP59242 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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CgnP59242 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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