Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp3P58854 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tubgcp3P58854 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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