Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd4P58467 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Setd4P58467 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Setd4P58467 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Setd4P58467 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Setd4P58467 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms