Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp1P52624 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp1P52624 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp1P52624 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp1P52624 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp1P52624 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp1P52624 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp1P52624 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp1P52624 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp1P52624 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms