Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms