Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms