Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
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Rpl28P41105 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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