Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
VhlP40338 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
VhlP40338 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
VhlP40338 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
VhlP40338 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
VhlP40338 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
VhlP40338 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
VhlP40338 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VhlP40338 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VhlP40338 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
VhlP40338 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms