Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lig1P37913 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lig1P37913 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lig1P37913 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms