Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptk2P34152 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptk2P34152 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptk2P34152 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptk2P34152 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ptk2P34152 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptk2P34152 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptk2P34152 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptk2P34152 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptk2P34152 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptk2P34152 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptk2P34152 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptk2P34152 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptk2P34152 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptk2P34152 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptk2P34152 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptk2P34152 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptk2P34152 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptk2P34152 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptk2P34152 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptk2P34152 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ptk2P34152 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptk2P34152 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ptk2P34152 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ptk2P34152 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptk2P34152 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptk2P34152 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptk2P34152 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptk2P34152 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptk2P34152 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptk2P34152 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptk2P34152 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ptk2P34152 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ptk2P34152 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ptk2P34152 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptk2P34152 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptk2P34152 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptk2P34152 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptk2P34152 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ptk2P34152 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptk2P34152 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptk2P34152 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptk2P34152 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptk2P34152 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ptk2P34152 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptk2P34152 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptk2P34152 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptk2P34152 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptk2P34152 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptk2P34152 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptk2P34152 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptk2P34152 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptk2P34152 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptk2P34152 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptk2P34152 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptk2P34152 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptk2P34152 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptk2P34152 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptk2P34152 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptk2P34152 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptk2P34152 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptk2P34152 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptk2P34152 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptk2P34152 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptk2P34152 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptk2P34152 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ptk2P34152 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptk2P34152 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms