Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms