Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kif5cP28738 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms