Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl3P27659 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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