Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms