Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms