Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpraP18052 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpraP18052 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpraP18052 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpraP18052 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpraP18052 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpraP18052 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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