Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms