Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PolP11369 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PolP11369 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PolP11369 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PolP11369 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PolP11369 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PolP11369 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PolP11369 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PolP11369 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PolP11369 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PolP11369 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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PolP11369 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PolP11369 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PolP11369 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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PolP11369 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PolP11369 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PolP11369 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolP11369 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolP11369 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolP11369 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolP11369 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolP11369 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolP11369 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolP11369 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolP11369 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PolP11369 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolP11369 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolP11369 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolP11369 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolP11369 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PolP11369 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolP11369 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PolP11369 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PolP11369 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolP11369 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolP11369 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolP11369 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolP11369 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolP11369 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PolP11369 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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