Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm3P0DP28 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm3P0DP28 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms