Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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