Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnfP06804 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnfP06804 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnfP06804 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnfP06804 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnfP06804 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TnfP06804 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnfP06804 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnfP06804 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnfP06804 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnfP06804 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnfP06804 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnfP06804 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnfP06804 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnfP06804 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnfP06804 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnfP06804 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnfP06804 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnfP06804 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnfP06804 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnfP06804 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnfP06804 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnfP06804 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnfP06804 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnfP06804 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnfP06804 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnfP06804 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnfP06804 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnfP06804 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnfP06804 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnfP06804 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnfP06804 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnfP06804 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnfP06804 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnfP06804 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms