Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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H2-Eb1P04230 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
H2-Eb1P04230 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
H2-Eb1P04230 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
H2-Eb1P04230 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
H2-Eb1P04230 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
H2-Eb1P04230 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-Eb1P04230 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-Eb1P04230 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-Eb1P04230 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-Eb1P04230 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-Eb1P04230 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-Eb1P04230 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-Eb1P04230 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-Eb1P04230 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-Eb1P04230 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-Eb1P04230 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-Eb1P04230 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-Eb1P04230 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-Eb1P04230 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-Eb1P04230 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-Eb1P04230 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-Eb1P04230 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-Eb1P04230 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-Eb1P04230 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-Eb1P04230 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-Eb1P04230 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-Eb1P04230 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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