Protein–RNA interactions for Protein: P01647

Ig kappa chain V-V region HP 124E1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01647 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01647 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01647 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01647 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01647 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01647 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P01647 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01647 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01647 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P01647 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01647 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01647 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01647 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01647 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01647 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01647 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01647 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01647 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01647 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01647 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01647 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01647 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01647 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01647 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01647 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01647 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01647 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01647 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01647 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01647 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01647 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01647 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01647 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01647 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01647 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01647 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01647 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01647 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01647 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01647 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P01647 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01647 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01647 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01647 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01647 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01647 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01647 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01647 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01647 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01647 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01647 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01647 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01647 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01647 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01647 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P01647 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01647 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01647 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P01647 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01647 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01647 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01647 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01647 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01647 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01647 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01647 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01647 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01647 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01647 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01647 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P01647 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01647 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01647 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01647 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01647 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01647 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P01647 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01647 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01647 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01647 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms