Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms