Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BckdkO55028 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BckdkO55028 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdkO55028 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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