Protein–RNA interactions for Protein: O54910

Nfkbie, NF-kappa-B inhibitor epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbieO54910 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbieO54910 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfkbieO54910 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms