Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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