Protein–RNA interactions for Protein: O35973

Per1, Period circadian protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per1O35973 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Per1O35973 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Per1O35973 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Per1O35973 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Per1O35973 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Per1O35973 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Per1O35973 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Per1O35973 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Per1O35973 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Per1O35973 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Per1O35973 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Per1O35973 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Per1O35973 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Per1O35973 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Per1O35973 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Per1O35973 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Per1O35973 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Per1O35973 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Per1O35973 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Per1O35973 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Per1O35973 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Per1O35973 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Per1O35973 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Per1O35973 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Per1O35973 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Per1O35973 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Per1O35973 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Per1O35973 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Per1O35973 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Per1O35973 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Per1O35973 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Per1O35973 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Per1O35973 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Per1O35973 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Per1O35973 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Per1O35973 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Per1O35973 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Per1O35973 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Per1O35973 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Per1O35973 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Per1O35973 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Per1O35973 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Per1O35973 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Per1O35973 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Per1O35973 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Per1O35973 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Per1O35973 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Per1O35973 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Per1O35973 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Per1O35973 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Per1O35973 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Per1O35973 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Per1O35973 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Per1O35973 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Per1O35973 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Per1O35973 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Per1O35973 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Per1O35973 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Per1O35973 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Per1O35973 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Per1O35973 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Per1O35973 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Per1O35973 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Per1O35973 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Per1O35973 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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