Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih1O35372 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms