Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

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Length 966 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkd2O35245 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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