Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx2O08686 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx2O08686 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Barx2O08686 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Barx2O08686 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Barx2O08686 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms