Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MttpO08601 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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MttpO08601 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MttpO08601 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MttpO08601 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MttpO08601 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MttpO08601 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MttpO08601 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MttpO08601 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MttpO08601 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MttpO08601 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms