Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms