Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XntrpcF8VQM8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms