Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colca2F8VPY8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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