Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Crocc2F6XLV1 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms