Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms